长安的花

当学问走过漫漫古道
凿刻入千窟,心也从愚昧中苏醒

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Whole Slide Image(WSI) 介绍

WSI 简介

WSI是Whole Slide Image的缩写,翻译是全幻灯片图像(自己翻译的,可能不准^.^),他是一种病理组织切片图,其像素是 gigapixel, 亿万像素级别。与寻常用于深度学习的图片大小 256x256 不同。在放入神经网络中进行训练前,需要对图片进行预处理。将其切块,获取补丁,从而达到适合机器学习的大小。

格式

其格式一般时 tif, 标签格式是 xml。可以参考下面这个网址上的数据集。里面还分不同的level, level 0一般会超内存。

https://camelyon17.grand-challenge.org/

打开方式

WSI像素十分夸张,一般的图片浏览软件打不开,官网推荐使用 ASAP 往下拉,可以找到合适的安装包。

图片中蓝色框里的就是标记部分。

Patch 的获取

Patch的获取网上有很多方法,得找到适合自己用的,之后会重开一章详细讲述。不过有一点是明确的,就是对电脑有点要求,不然会MemoryError

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